الفرق الرئيسي بين النوية والنواة هو أن

النوية هي بنية داخل النواة

، بينما

النواة هي العضية الرئيسية في الخلية حقيقية النواة التي تحتوي على المادة الوراثية (DNA).

بمعنى آخر، النواة هي الكل، والنوية هي جزء من الكل. النوية هي منطقة كثيفة داخل النواة مسؤولة عن تجميع ريبوسومات الخلية. النواة، من ناحية أخرى، تحيط بها غشاء نووي وتحتوي على الكروموسومات بالإضافة إلى النوية. النوية ليست بنية مستقلة محاطة بغشاء، على عكس النواة.