تعتمد طرق الفصل الكروماتوجرافي على اختلافات في خواص المواد التي يتم فصلها، مثل : القابلية للذوبان، القطبية، الحجم، الشحنة، وغيرها. وتنقسم طرق الفصل الكروماتوجرافي إلى عدة أنواع رئيسية، بناءً على آلية الفصل وطور الفصل المتحرك (المُحَلِّل) والطور الثابت (الوسط الكروماتوجرافي):

1. حسب آلية الفصل:

*

الكروماتوغرافيا الامتزازية (Adsorption Chromatography):

تعتمد على اختلافات في قوة امتزاز المواد على سطح الطور الثابت. تستخدم مادة صلبة مسامية (مثل السيليكا الجيل أو الألومينا) كطور ثابت.
*

الكروماتوغرافيا التقسيمية (Partition Chromatography):

تعتمد على اختلافات في قابليّة المواد للذوبان بين طورين سائلين غير قابلين للامتزاج، حيث يكون أحدها ثابتاً والآخر متحركاً.
*

الكروماتوغرافيا الأيونية (Ion-Exchange Chromatography):

تستعمل طورًا ثابتًا يحتوي على مواقع تحمل شحنات كهربائية (أيونيّة) لتمييز الأيونات بناءً على اختلاف شحناتها.
*

الكروماتوغرافيا الحجمية الاستبعادية (Size-Exclusion Chromatography) أو (Gel Filtration Chromatography):

تفصل المواد بناءً على أحجامها الجزيئية. تمر الجزيئات الكبيرة بشكل أسرع عبر العمود الكروماتوغرافي لأنها لا تخترق مسام الطور الثابت، بينما الجزيئات الأصغر تخترق المسام وتأخذ وقتًا أطول.
*

الكروماتوغرافيا التقاربية (Affinity Chromatography):

تعتمد على التفاعل الخاص بين المادة المُراد فصلها وجزيء مُحدد (ليغاند) مُثبّت على الطور الثابت.
*

الكروماتوغرافيا الفائقة الأداء (High-Performance Liquid Chromatography - HPLC):

تُستخدم ضغوط عالية لزيادة سرعة الفصل ودقته، وتُعتبر تقنية مُتطورة تُستخدم في أنواع متعددة من آليات الفصل المذكورة أعلاه.

2. حسب طور الفصل المتحرك:

*

الكروماتوغرافيا الغازية (Gas Chromatography - GC):

يكون الطور المتحرك غازًا حاملًا (مثل الهيليوم أو النيتروجين). تستخدم لفصل المركبات المتطايرة.
*

الكروماتوغرافيا السائلة (Liquid Chromatography - LC):

يكون الطور المتحرك سائلاً. تُستخدم لفصل المركبات غير المتطايرة، ويشمل ذلك HPLC.

3. حسب شكل الطور الثابت:

*

الكروماتوغرافيا العمودية (Column Chromatography):

يستخدم عمود زجاجي أو معدني مليء بالطور الثابت.
*

الكروماتوغرافيا الطبقية الرقيقة (Thin-Layer Chromatography - TLC):

يستخدم لوح زجاجي أو بلاستيكي مُغطى بطبقة رقيقة من الطور الثابت.
*

الكروماتوغرافيا الورقية (Paper Chromatography):

يستخدم ورق ترشيح كطور ثابت.


هذه ليست قائمة شاملة لجميع تقنيات الفصل الكروماتوغرافي، بل هي عرض للأنواع الرئيسية. يوجد العديد من الاختلافات والتركيبات بين هذه الأنواع الأساسية، واختيار التقنية المناسبة يعتمد على طبيعة المواد التي يتم فصلها وخصائصها.