سمي المسجد الأقصى بهذا الاسم لكونه

أقصى مسجد بُني على الأرض من المساجد الثلاثة التي بناها النبي إبراهيم عليه السلام

، وذلك من وجهة نظر المسلمين. ويشير "الأقصى" هنا إلى البعد المكاني من مكة المكرمة، أبعد من المسجد الحرام والمسجد النبوي. فهو الأبعد من بين تلك المساجد الثلاثة المقدسة عند المسلمين. وهذا لا ينفي وجود مساجد أخرى أبعد جغرافيًا، لكن الاسم مرتبط بالتاريخ الإسلامي المبكر وتلك المساجد الثلاثة.